El largometraje retorna al principio de la saga para rescatar el momento impactante en el que Magneto de niño es llevado Auschwitz y apartado de su familia, para retomar el hilo conductor de la historia, la cual introduce al espectador en los orígenes de X-Men.
La carrera armamentista de los años sesenta lleva a las dos potencias mundiales, Estados Unidos y Rusia a una crisis diplomática durante la guerra fría, desencadenada por el descubrimiento de misiles en Cuba. Argumento que sirve de fondo a la trama de la película.
En la quinta entrega se renuevan los personajes, cambiando el repertorio y la linea de la historia, que deja en abierto la continuación. Con la presentación de nuevos personajes e interrogantes, dejan al espectador intrigado, deseoso de más.