La historia trata de los Skylanders seres mágicos con poderes y armas que protegen el mundo mágico de Skylands del malvado KAOS, tirano que los ha congelado y desterrado a la Tierra, sumiendo al territorio en la más profunda oscuridad. Ahora el protagonista del juego "Maestro del portal" tiene que traerlos de nuevo a la vida y salvar Skylands para siempre, ayudado del portal mágico.
Skyalands es un mundo imaginario donde se divide en niveles que el protagonista debe recorrer para cumplir una serie de objetivos con los Skylanders, pequeñas figuras inanimadas que cobran vida a través del portal mágico, cada una con una serie de poderes y habilidades necesarias para cumplir las misiones.
Un juego interactivo que une el videojuego con los juguetes de forma que el niño puede jugar fuera del mundo virtual con sus protagonistas sin más componentes que su imaginación, convirtiéndose en el creador y protagonista de nuevas historias, desarrolladas a partir de pequeñas figuritas de plástico donde Spyro es el protagonista.